El segundo torneo más importante del fútbol sudamericano definió mediante el sorteo los emparejamientos de la segunda fase. En esta etapa figuran los 22 clubes que avanzaron de la ronda anterior y, se suman los diez provenientes de la Copa Libertadores.
El fútbol paraguayo tiene tres representantes en la siguiente etapa de la Sudamericana y las series definidas son: Gral. Díaz-Millonarios, Nacional-Botafogo y Sol-Nacional de Uruguay.
El único equipo que no pudo seguir fue el Sportivo Luqueño, luego de ser derrotado por el Deportivo Cuenca de Ecuador.
El bombo 1: Banfield, Colón, Bolívar, Jorge Wilstermann, Vasco da Gama, Botafogo, Deportes Temuco, Independiente Santa Fe, Atlético Junior, Millonarios, El Nacional de Quito, Sport Huancayo, Peñarol, Cerro de Montevideo, Defensor Sporting y Nacional de Montevideo.
El bombo 2:Lanús, San Lorenzo de Almagro, Defensa y Justicia, Atlético Paranaense, Sao Paulo, Fluminense, Bahía, Deportivo Cali, Liga Deportiva Universitaria, Deportivo Cuenca, Nacional, Sol de América, General Díaz, Rampla Juniors, Boston River y Caracas.
Las series:
Gral. Díaz-Millonarios
Nacional-Botafogo
Sol-Nacional de Uruguay
Sao Paulo-Colón
Boston River-Banfield
Fluminense-Defensor Sporting
Atlético Paranaense-Peñarol
Deportivo Cali-Bolívar
LDQuito-Vasco da Gama
Caracas-Sport Huancayo de Perú
Deportivo Cuenca-Jorge Wilstermann
Defensa y Justicia-El Nacional de Ecuador
Lanús-Junior
San Lorenzo-Deportes Temuco
Bahía-Cerro de Uruguay
Rambla Juniors-Independiente Santa Fe