El 2016 además fue testigo de un hecho doloroso para el fútbol paraguayo: el retiro de Roque Santa Cruz, una leyenda de la Albirroja, que se va siendo el goleador histórico con 32 tantos en 111 partidos.

La despedida fue amarga para el "Babygol", ya que Paraguay protagonizó un papelón y perdió por primera vez en casa por Eliminatorias ante Perú.

"No es una decisión fácil y mucho menos hablar de esto", dijo con la voz quebrada en su última conferencia en Ypané. Dio a entender que aún no quería abandonar la selección, pero como siempre fue sincero, explicando que la decisión pasa por darle lugar a los jóvenes que vienen presionando y también porque el físico ya no le responde como antes.

Hizo 13 goles por Eliminatorias, festejó 1 tanto en una Copa del Mundo (Corea-Japón 2002), 7 en Copas América y el resto en amistosos.