Guaraní en todo su historial tiene 11 títulos hasta el momento desde su fecha de fundación, que fue el 12 de octubre de 1903. El Legendario ganó los torneos de 1906; 1907; 1921; 1923; 1949; 1964; 1967; 1969; 1984; 2010 y 2016.
En 1996, el equipo aborigen se adjudicó el torneo Apertura, pero ese torneo en aquel entonces no se contabilizaba como un título.
El equipo de Dos Boca fue el primer bicampeón e invicto (1906- 1907)
Guaraní ganó invicto el Primer Campeonato Oficial del Fútbol Paraguayo en 1906, logrando 18 de los 20 puntos posibles, con 32 goles a favor y solo 2 en contra. Los equipos participantes fueron Guaraní, Olimpia, Libertad, Nacional, General Díaz y 14 de mayo.
El segundo campeonato organizado por la liga se disputó en el año 1907 con los mismos participantes que en el primero; Guaraní impuso de nuevo su gran calidad de equipo ganando, otra vez de forma invicta, el torneo con 16 puntos. Con esto, el legendario es el primer y único bicampeón invicto del fútbol paraguayo.
La década de los '60 fue definida como la "época de oro" para el club Guaraní, que conformó un buen plantel. Tras el título logrado en 1964 se produjo la conquista de 1967, con la misma base.
La década de los '60 se cerraba para Guaraní con otra gran campaña, la de 1969, que significaba el tercer título del decenio.
En 1984 ganó su noveno campeonato en la primera categoría del balompié paraguayo, con Cayetano re como técnico del plantel.
Su décimo título lo ganó en el 2010 bajo la dirección técnica de Félix Darío León.
Hoy de nuevo el equipo aborigen inscribe su nombre como campeón del fútbol paraguayo y se anota como segundo representante en la próxima edición de la Copa Libertadores de América y jugará directamente la fase de grupos.
Olimpia clasifica por el acumulativo y deberá buscar su clasificación tras la fase previa que consta de dos etapas.